| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-448 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-448 Cfa-Mir-448 Cja-Mir-448 Cpo-Mir-448 Eca-Mir-448 Ete-Mir-448 Hsa-Mir-448 Laf-Mir-448 Mml-Mir-448 Mmr-Mir-448 Ocu-Mir-448 Pab-Mir-448 Rno-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 147158221-147158300 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAGUUGUCCUUCCCAUGGACGAGGAGGUUGAACAUCCUGCAUAGUGCUGCCAGGAAAUCCCUACUUCAUACUAAGAGGGGGCUGGCUGGUUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAUCUCCUGGCCCACUUCGUCAUGACAGAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 GCAGUUGUCCUUCCCAU- A-|G UGA G U AGGAAAUCCCUACUUCA GG C AGGAGGU ACAUCCUGCAUA UGC GCC U CC G UCCUCUA UGUAGGAUGUAU ACG UGG A AUAGACAGUACUGCUUCA CG^- CCC - U UCGGUCGGGGGAGAAUC . 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-448_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACAUCCUGCAUAGUGCUGCC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-448-5p miRDB: MIMAT0017176 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-448_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
60- UUGCAUAUGUAGGAUGUCCC -80
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0001533 TargetScanVert: mmu-miR-448-3p miRDB: MIMAT0001533 |
