| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-448 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-448 Cfa-Mir-448 Cja-Mir-448 Cpo-Mir-448 Eca-Mir-448 Ete-Mir-448 Hsa-Mir-448 Laf-Mir-448 Mml-Mir-448 Mmu-Mir-448 Ocu-Mir-448 Pab-Mir-448 Rno-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 42708386-42708465 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-448) |
Mir-1911
CM007693.1: 42669472-42669530 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-448 CM007693.1: 42708386-42708465 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGCAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGUUGACCUUCACAUGGGCGGGGAGGUUGAACAUCCUGCAUAGUGCUGCCAGGAAAUCCCUAUUUAAUACUAAGAGGGGGCUGGCUGGUUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAUCUCCCAGCUCACUUCGUCAUGACAGAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 GCUGUUGACCUUCACAU-| G UGA G U AGGAAAUCCCUAUUUAA GGGC GGGAGGU ACAUCCUGCAUA UGC GCC U CUCG CCCUCUA UGUAGGAUGUAU ACG UGG A CUAGACAGUACUGCUUCA^ A CCC - U UCGGUCGGGGGAGAAUC . 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-448_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACAUCCUGCAUAGUGCUGCC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-448_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
60- UUGCAUAUGUAGGAUGUCCC -80
Get sequence
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