| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-459 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-459 Bta-Mir-459 Cfa-Mir-459 Cja-Mir-459 Cli-Mir-459 Cpi-Mir-459 Cpo-Mir-459 Dno-Mir-459 Dre-Mir-459 Ebu-Mir-459 Eca-Mir-459 Ete-Mir-459 Gmo-Mir-459 Hsa-Mir-459 Laf-Mir-459 Loc-Mir-459 Mal-Mir-459 Mml-Mir-459 Mmr-Mir-459 Mun-Mir-459 Oan-Mir-459 Ocu-Mir-459 Pab-Mir-459 Pma-Mir-459 Rno-Mir-459 Spt-Mir-459 Sto-Mir-459 Tni-Mir-459 Xla-Mir-459-P1 Xla-Mir-459-P2 Xtr-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr16: 93369737-93369797 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCUACCGACUGCGGUCCUAUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCAAUCAUACAACACGGAGAGUCUUUGUCACUCAGUGUAAUUAAUAGCCUUCACCUCGAAAGGGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACCUACCGACUGCGGUC--| U AUC A A U GUCAA CUAUUA UUGCA AGU ACAAAGAUUC UCC UGU U GAUAAU AAUGU UCA UGUUUCUGAG AGG ACA C AAGGGAAAGCUCCACUUCC^ U GAC C - C ACAUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-459_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004188 TargetScanVert: mmu-miR-802-5p miRDB: MIMAT0004188 |
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| Co-mature sequence | Mmu-Mir-459_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0017240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- ACGGAGAGUCUUUGUCACUCAGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-802-3p miRDB: MIMAT0017240 |






