| MirGeneDB ID | Ete-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-432 Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Dno-Mir-432 Eca-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Mmr-Mir-432 Ocu-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980297: 82397342-82397410 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-136-v1
JH980297: 82397135-82397190 [-]
UCSC
Mir-136-v2 JH980297: 82397135-82397190 [-] UCSC Mir-432 JH980297: 82397342-82397410 [-] UCSC Mir-127 JH980297: 82398910-82398965 [-] UCSC Mir-433 JH980297: 82399996-82400069 [-] UCSC Mir-431 JH980297: 82400847-82400910 [-] UCSC Mir-493 JH980297: 82413472-82413532 [-] UCSC |
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| Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCUCAAGCCAUUGCGUGACUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUCUAUUUCCUGAUGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGAUCAAUGGGCAGCUCUUCCAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCUCAAGCCAUUGCG- -| C UGUCU UA G AUCCUCUAUU UGA CU CUCCA UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACU GA GAGGU ACCUC UCGGUAG UCACC C UUACCUUCUCGACGGGUA A^ U UCUGU C- G GGGUGUAGUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-432_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGA -24
Get sequence
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| Star sequence | Ete-Mir-432_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCU -69
Get sequence
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