| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-590 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-590 Cfa-Mir-590 Dno-Mir-590 Eca-Mir-590 Mml-Mir-590 Mmr-Mir-590 Oan-Mir-590 Ocu-Mir-590 Pab-Mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chr7: 74191213-74191273 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUUUUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCUUAAAAGUCCUGUAGCCAGUCAGAAAUGAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAGUAUGGUGAAGUCAAUCUGUAAUUUUAUGUAUAAGCUAGUCUCUGAUUGAAACAUGCAGCAGCUGUCUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCUUAAAAGUCCUGUAGC--| A G U G UAUGGUG CAGUCAGA AU AGCUUAU CAUAAAA UGCAG \ GUUAGUCU UG UCGAAUA GUAUUUU AUGUC A CUUCUGUCGACGACGUACAAA^ C A U A UAACUGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hsa-Mir-590_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0003258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003258 TargetScanVert: hsa-miR-590-5p TargetMiner: hsa-miR-590-5p miRDB: MIMAT0003258 |
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| Mature sequence | Hsa-Mir-590_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAAUUUUAUGUAUAAGCUAGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004801 TargetScanVert: hsa-miR-590-3p TargetMiner: hsa-miR-590-3p miRDB: MIMAT0004801 |






