| MirGeneDB ID | Ete-Mir-185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-185 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-185 Cfa-Mir-185 Cja-Mir-185 Cpo-Mir-185 Dno-Mir-185 Eca-Mir-185 Hsa-Mir-185 Laf-Mir-185 Mml-Mir-185 Mmr-Mir-185 Mmu-Mir-185 Ocu-Mir-185 Pab-Mir-185 Rno-Mir-185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980301: 71891276-71891331 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-185) |
Mir-1306
JH980301: 71846469-71846529 [-]
UCSC
Mir-185 JH980301: 71891276-71891331 [-] UCSC |
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| Seed | GGAGAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGGCCUGGCUUGAGUGGGGGGUGAGGGGCUGGAGAGAAAGGCAGUCCCUGAUGGUCCCCUCCCCAGGGGCUGGUUUUCCUCUGGUCCUUCCUUCCCAAUGACCGCGUCUUUGUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAGGCCUGGCUUGAGUG--| U UG A G AUGGUC GGGGG GAGGGGC GAG GAAAG CAGUCCCUG \ CCCUU CUUCCUG CUC CUUUU GUCGGGGAC C ACUGUUUCUGCGCCAGUAA^ C GU - G CCCUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-185_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAGAGAAAGGCAGUCCCUGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Ete-Mir-185_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AGGGGCUGGUUUUCCUCUGGU -56
Get sequence
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