| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-185 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-185 Cfa-Mir-185 Cja-Mir-185 Cpo-Mir-185 Dno-Mir-185 Eca-Mir-185 Ete-Mir-185 Hsa-Mir-185 Laf-Mir-185 Mml-Mir-185 Mmr-Mir-185 Mmu-Mir-185 Pab-Mir-185 Rno-Mir-185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chrUn0128: 681999-682054 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-185) |
Mir-1306
chrUn0128: 646580-646640 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-185 chrUn0128: 681999-682054 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | GGAGAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGGGCCUGGCUCGACUGGGGGGCGAGGGAUUGGAGAGAAAGGCAGUUCCUGAUGUUCCCCUCCCCAGGGGCUGGCUUUCCUCUGGUUCUUCCCUCCCAAUGACCGCGUCUUCGCUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGGGCCUGGCUCGACUG--| C UG A G AUGUUC GGGGG GAGGGAU GAG GAAAG CAGUUCCUG \ CCCUC CUUCUUG CUC CUUUC GUCGGGGAC C GUCGCUUCUGCGCCAGUAA^ C GU - G CCCUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-185_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAGAGAAAGGCAGUUCCUGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-185_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AGGGGCUGGCUUUCCUCUGGU -56
Get sequence
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