| MirGeneDB ID | Mal-Mir-2184-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mal-Mir-2184-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-2184 Cpi-Mir-2184 Gga-Mir-2184 Gmo-Mir-2184 Lch-Mir-2184 Loc-Mir-2184 Mun-Mir-2184 Xtr-Mir-2184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884840.1: 363423-363481 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2184-P2) |
Mir-2184-P2
KV884840.1: 363423-363481 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-132-P1a KV884840.1: 364190-364252 [-] UCSC Ensembl Mir-132-P2a KV884840.1: 364461-364528 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | ACAGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAAUUUUAUGAUCUCAGUCUUGGGCUCUGAACAGUAAGAGUUUAUGUGCUGCUAGAAAGAAGCUCAGCAUGUAGAGUCUUACAGUGCAGAGACAAAGACCAGGCAUCUCUAAAAAAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAAUUUUAUGAUCUCA--| GGG A A G CUAGAA GUCUU CUCUG AC GUAAGA UUUAUGUGCUG \ CAGAA GAGAC UG CAUUCU AGAUGUACGAC A GAAAAAAAUCUCUACGGAC^ ACA G A G UCGAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mal-Mir-2184-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACAGUAAGAGUUUAUGUGCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Mal-Mir-2184-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GCAUGUAGAGUCUUACAGUGCA -59
Get sequence
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