| MirGeneDB ID | Mun-Mir-2184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-2184 Cmi-Mir-2184-v1 Cpi-Mir-2184 Dre-Mir-2184-P1a Dre-Mir-2184-P1b Gga-Mir-2184 Gmo-Mir-2184 Lch-Mir-2184 Loc-Mir-2184 Mal-Mir-2184-P1 Mal-Mir-2184-P2 Tni-Mir-2184-P1 Xla-Mir-2184-P3 Xla-Mir-2184-P4 Xtr-Mir-2184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594644.1: 61073816-61073876 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2184) |
Mir-132-P2
LR594644.1: 61036687-61036753 [+]
Mir-132-P1 LR594644.1: 61054185-61054243 [+] Mir-2184 LR594644.1: 61073816-61073876 [-] |
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| Seed | ACAGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCCUUGCUCUGUCUCUGCCUGUUUUUCUAAACAGUAAAAGUUUAUGUGCUGUGGCAUUUGACAAACCAGCACAGAAACAUUUACUGUUAAGAGAGGCAGGAAAAAGAAGAGGCAACAAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCCCUUGCUCUGUCUCUG--| A A A UGGCAUU CCUGUUUUUCU AACAGUAAA GUUU UGUGCUG \ GGACGGAGAGA UUGUCAUUU CAAA ACACGAC U GAAACAACGGAGAAGAAAAA^ A A G CAAACAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mun-Mir-2184_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACAGUAAAAGUUUAUGUGCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Mun-Mir-2184_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- GCACAGAAACAUUUACUGUUAA -61
Get sequence
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