| MirGeneDB ID | Lhy-Mir-1984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1984 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Laevipilina (Monoplacophora) (Laevipilina hyalina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Esc-Mir-1984 Hru-Mir-1984-P1 Hru-Mir-1984-P2 Lgi-Mir-1984-P1 Lgi-Mir-1984-P2 Mgi-Mir-1984-P1 Mgi-Mir-1984-P2 Npo-Mir-1984 Obi-Mir-1984-P3 Obi-Mir-1984-P4 Ovu-Mir-1984-P3 Ovu-Mir-1984-P4 Pve-Mir-1984-P1 Pve-Mir-1984-P2 Rph-Mir-1984-P1 Rph-Mir-1984-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Conchifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Conchifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Mono_atcgn_nospaces) |
scaffold242045_17.2: 95-150 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GCCCUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUUAAUUAUACCCUUUGUUUCGUCCGCUGUGCCCUAUGCUUCAGCCACGGUGUUGAUGUUGCACAGUGGUUGCUGCUAGGGCCCAACGUGCGCAACUCGAUUCGUCGAAGAGUAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAUUAAUUAUACCCUUU--| U UC C U U UU G UUGA GUU CG CG UG GCCCUA GC CAGCCAC GUG \ CAA GC GC AC CGGGAU CG GUUGGUG CAC U AAUGAGAAGCUGCUUAGCU^ C GU A C - UC A GUUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lhy-Mir-1984_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCCCUAUGCUUCAGCCACGGUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Lhy-Mir-1984_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CAGUGGUUGCUGCUAGGGCCCA -56
Get sequence
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