| MirGeneDB ID | Mun-Mir-19-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-19 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mun-Mir-19-P1a Mun-Mir-19-P2a Mun-Mir-19-P2c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cmi-Mir-19-P2d Dre-Mir-19-P2d Gmo-Mir-19-P2d Lch-Mir-19-P2d Loc-Mir-19-P2d Mal-Mir-19-P2d Tni-Mir-19-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594645.1: 20660764-20660826 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-19-P2d) |
Mir-19-P2d
LR594645.1: 20660764-20660826 [-]
Mir-17-P4d LR594645.1: 20661180-20661241 [-] |
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| Seed | GUGCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCAUCCAUGUUUUGGUGCUGGUUCCGGUCCGUUUUGCAGGGUCAGCAUUCAGUCUGGAUCAUGUUCUGCUGUGCAAACCCAUGCAAAACUGAUCGUAGCUAACAUAAUAACCUCCUGCCUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCCAUCCAUGUUUUGGU-- C C C -| CA UU CUGGAU G UGGUU CGGUC GUUUUGCA GGGU GCA CAGU C C AUCGA GCUAG CAAAACGU CCCA CGU GUCG A GGUCCGUCCUCCAAUAAUA A U U A^ AA -- UCUUGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mun-Mir-19-P2d_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGUUUUGCAGGGUCAGCAUUCAGU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Mun-Mir-19-P2d_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGUGCAAACCCAUGCAAAACUGA -63
Get sequence
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